Le long du Thérain, affluent de l'Oise, Villers-Saint-Sépulcre est un bourg rural du département de l'Oise, en région Hauts-de-France. La commune appartient à l'unité urbaine de Hermes, dont elle est une commune de la banlieue, et fait partie de la couronne de l'aire d'attraction de Paris. Elle s'inscrit dans le bassin Seine-Normandie : le Thérain, long de 94 km, naît à Gaillefontaine et rejoint l'Oise à Saint-Leu-d'Esserent après avoir traversé 43 communes. Plusieurs plans d'eau jalonnent la vallée sur le territoire communal, aux côtés de sablières partagées avec Montreuil-sur-Thérain et d'un plan d'eau de Bailleul-sur-Thérain. La gestion de l'eau y relève d'un schéma d'aménagement porté par le syndicat intercommunal de la Vallée du Thérain. Côté vie locale, une médiathèque est installée dans la commune. Pour signaler un problème de voirie, un défaut d'entretien des espaces verts, une défaillance de l'éclairage public ou un dépôt sauvage, les habitants transmettent leur demande à la mairie de Villers-Saint-Sépulcre via Signaleo.

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