Membre de la communauté de communes du Fronsadais, Saint-Genès-de-Fronsac se situe dans le département de la Gironde, en région Nouvelle-Aquitaine, et dépend du canton du Nord-Gironde. La commune est limitrophe de Marcenais, Mouillac, Périssac, Val de Virvée et Vérac. Commune rurale à habitat dispersé, située hors unité urbaine, elle fait partie de l'aire d'attraction de Bordeaux, dont elle est une commune de la couronne. Son territoire, entièrement exposé au retrait-gonflement des sols argileux, a été reconnu en état de catastrophe naturelle à plusieurs reprises, notamment pour des inondations et coulées de boue en 1982, 1999 et 2009. Pour signaler un problème de voirie, une défaillance de l'éclairage public, un dépôt sauvage ou un défaut d'entretien des espaces verts, les habitants transmettent leur demande à la mairie de Saint-Genès-de-Fronsac via Signaleo.

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