Bordée au nord par le Dropt, Saint-Exupéry est une commune de l'Entre-deux-Mers située dans le département de la Gironde, en région Nouvelle-Aquitaine, à 55 km au sud-est de Bordeaux et à 8 km au nord-ouest de La Réole. Langon, chef-lieu d'arrondissement, se trouve à 18 km. Ses communes limitrophes sont Camiran à l'est, Morizès au sud, Saint-Laurent-du-Plan au sud-ouest, Saint-Laurent-du-Bois à l'ouest et Saint-Félix-de-Foncaude au nord. Le bourg est traversé par la route départementale D131, qui mène au nord vers Sauveterre-de-Guyenne et au sud-est vers Camiran, tandis que la D9 conduit à La Réole. L'accès le plus proche à l'autoroute A62 est l'échangeur de La Réole, et la gare la plus proche, à 9 km, est celle de La Réole, sur la ligne Bordeaux-Sète. Pour une défaillance de l'éclairage public, un dépôt sauvage, une route abîmée ou un défaut d'entretien des espaces verts, les habitants transmettent leur demande à la mairie de Saint-Exupéry via Signaleo.

Mairie - Saint-Exupéry