Entre les vallées de la Selle et de la Noye, Bonneuil-les-Eaux est un village rural du Plateau picard, situé entre Beauvais et Amiens aux confins de l'Oise et de la Somme, dans le département de l'Oise, en région Hauts-de-France. La commune est accessible par la sortie 16 de l'autoroute A16 ou par la route nationale 1, et voisine notamment Fransures, Paillart, Esquennoy, Blancfossé, Croissy-sur-Celle et Gouy-les-Groseillers. Aucun cours d'eau ne la draine. L'église Saint-Nicolas, fondée au début du XIIe siècle comme église de prieuré-cure par l'abbé de Breteuil Guillaume II, possède trois chœurs et une nef du XVIe siècle ; son faux transept Renaissance et sa rose datent de 1570 et son clocher à tour carrée du XIIIe siècle. Elle est inscrite au titre des monuments historiques depuis 1997, tout comme, depuis 1998, la porte du XVIe siècle, vestige du prieuré. Une motte féodale subsiste de l'ancien château. Les habitants sont appelés les Bonneuillois et les Bonneuilloises. Pour signaler une voirie abîmée, un dépôt sauvage, un éclairage public défaillant ou des espaces verts mal entretenus, les habitants transmettent leur demande à la mairie de Bonneuil-les-Eaux via Signaleo.

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