À la confluence du Ravillou et de son affluent le Merdançon, le bourg de Saint-Germain-des-Prés se trouve dans le quart nord-est du département de la Dordogne, en région Nouvelle-Aquitaine. Traversé par la route départementale 76 et bordé à l'est par la RD 77, il se situe à quatre kilomètres et demi à l'ouest d'Excideuil et à une dizaine de kilomètres au sud-est de Thiviers. Le territoire communal, limitrophe de six communes, s'étage entre 127 mètres, là où le Ravillou quitte la commune entre Coulaures et Saint-Pantaly-d'Excideuil, et 297 mètres au nord, aux confins de Clermont-d'Excideuil et de Saint-Sulpice-d'Excideuil. Il repose sur un plateau de calcaires durs du Jurassique. Le réseau hydrographique, formé du Ravillou, des Vaux, du Merdançon et d'un petit cours d'eau, s'étire sur dix-sept kilomètres ; le Ravillou, né à Dussac, rejoint ensuite la Loue. La vie locale se retrouve chaque année lors de la fête patronale, organisée sur deux jours un week-end de fin juillet. Pour signaler une chaussée abîmée, un éclairage public défaillant ou des espaces verts mal entretenus, les habitants transmettent leur demande à la mairie de Saint-Germain-des-Prés via Signaleo.

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